口腔正畸学属于口腔科学的分支学科，和其他口腔专业学科有着密切的关系。如因某些错合畸形造成的牙周病，可以通过牙周病的正畸矫治进行治疗；而正畸治疗不当出现合创伤或戴用矫治器后不能保持口腔卫生则会造成牙龈炎或牙周炎。另外，如占口腔科常见病第4位的颞下颌关节紊乱病，错合畸形常为其主要病因之一，因而正畸治疗亦成为颞下颌关节紊乱病的主要治疗方法之一。而严重的骨骼畸形的错合畸形，则必须与口腔颌面外科共同完成正颌外科。因而口腔正畸学科与其他口腔专科的联系十分紧密。

口腔正畸学与一般医学基础学科及生物学科也有着广泛的联系。由于错合畸形大多在儿童生长发育过程中形成，因而儿童正常的牙颌颅面生长发育成为口腔正畸学的重要基础内容。错合畸形的形成有明显的演化、遗传因素。因而，遗传学及口腔科人类学与口腔正畸亦密切相关。此外，由于口腔正畸的过程是牙齿颌骨接受各种矫治力的过程，因而生物力学内容又成为口腔正畸矫治基础和临床研究中的重要方面。牙齿受力后牙周膜牙槽骨组织发生一系列(包括生理生化的生物特征等)变化，而成为牙齿移动生物学的专门内容。

口腔正畸学的发展一直与材料学的发展紧密相关,如粘接材料、金属矫治弓丝材料，生物陶瓷材料的发展也促进了口腔正畸学的发展。近年来计算机科技也进入错合畸形的机制、诊断分析、矫治设计、预后预测等研究领域。